Gromacs

cmakeを使ったバージョン4.6.1のインストール方法

分子動力学計算ソフトウェアGromacsのバージョン4.6から、従来のconfigure&makeではなくて、cmakeのみの対応となったようです。ここに僕のやり方を残しておきます。 参考:GROMACS 4.6 Installation Guide Installation Instructions - GromacsGromacsダウン…

g_analyze -hの日本語訳

原文:Gromacs Manuals - g_analysis 導入 g_analyzeはANCII形式のファイルを読み込んでその中のデータを解析します。入力ファイルに書かれた行の最初の列は"時間"の列として読み込みが開始され(-timeオプション参照)、その他の数値がデータ群として後に続…

Gromacsの便利な統計処理コマンドg_analyzeのマニュアルを訳してみた

Gromacs使っていても使っていなくても、g_analyzeが数値解析や統計に使えることがわかったのでこれからバンバン使っていこうと思いマニュアルを訳してみました。Gromacsのマニュアルは割りと充実しているので-hオプションを使ってヘルプを見れば大体のことが…