今度はintelコンパイラでインストールしてみます。ifortを付けるだけかと思いきやすんなりいかなかったのでログ。
「Charmm37をGPUバージョンでインストールしてみた(コンパイルまでのエラーの対処法)」
http://d.hatena.ne.jp/leetmikeal/20130204
GNUで通った時のソースコードをそのままコピーして使います。
cp -r /usr/local/c37b1_GPU /usr/local/c37b1_GPU_intel ./install.com gpu xxlarge ifort vi build/gpu/gpu.log Compiling CUDA interface for CHARMM cproto vtgrape.c >> vtgrapeproto.h /bin/sh: cproto: command not found make: *** [vtgrapeproto.h] Error 127
cprotoが無いというエラーが。cprotoはC言語のプロトタイプ宣言を出力してくれるプログラムですね。GNUの時は無かったのになぜ…。
yumでインストール
yum install -y cproto
再びインストール
./install.com gpu xxlarge ifort
10分ほど待った後、完了しました。