AmberTools13を以下の場所からダウンロードしてきてインストールしました。名前や所属等を聞かれますがすぐにダウンロードできます。古いバージョンが欲しい場合は下にリンクがあります。
http://ambermd.org/
http://ambermd.org/AmberTools-get.html
やり方は以下のサイトほぼそのままです。Ubuntu等のDebian系は詳細に説明があります。
http://jswails.wikidot.com/installing-amber12-and-ambertools-13
ではインストールをしてみます。
インストールの前に、依存関係のファイルを入れておくと良いです。
yum install tcsh yum install gcc gcc-c++ gcc-gfortran yum install flex flex-devel yum install libX11 libX11-devel yum install tcsh yum install zlib zlib-devel yum install bzip2 bzip2-devel # ここまで公式サイトに記述のある必須ライブラリ yum install libXt libXt-devel libXext-devel libICE-devel libSM-devel # configure時のエラー対処 yum install libXdmcp-devel # make install時のエラー対処
tar xjvf AmberTools13.tar.bz2 # Amber本体を持っている場合は、 # tar jxvf Amber12.tar.bz2 # をすると、amber12フォルダに必要なファイルが展開される。 # コンパイル方法は有り無し関係なく同じ。 cd amber12 ./configure gnu -noamber make install
これだけ。bin以下にツール群が入っています。
何かエラーが出たら、その英文を良く読んで対処しましょう。
